目前难以用肉眼判断是否属于转基因农作物，不过转基因食品一般有以下的特点：
1、色彩。与传统的不一样的绝对是转基因，比如彩色棉花、彩色辣椒。
2、季节。除了大棚蔬菜外，其它的反季节食品容易是转基因的。
3、个头。按照传统，西红柿也有一定个头的，比如：像大拇指头那么一点大的小西红柿绝对是转基因。再比如大豆，也叫黄豆，就是做豆腐，豆浆那种豆子，形状应该像动物内脏：腰的样子，有点扁，可现在的大豆，全是圆圆的、大不少、就像豌豆一样的大豆，产量很高，就是转基因。
4、害虫。凡是害虫喜欢光顾的作物就是没转基因的，凡是害虫害怕，也就是没有害虫，或很少害虫的作物，就是转基因。
5、产量。转基因作物一般在开始几年，其产量要比传统作物高不少。
市面上的粘玉米是转基因的吗?
粘玉米又称糯玉米，其特征为籽粒干燥后胚乳呈角质不透明无光泽的蜡质状，因此被命名为蜡质玉米。其化学性状和物理性状受单个隐性基因(wx)控制，这个基因位于第9染色体上。粘玉米是基因分离和自由组合，加上选择性表达：玉米本身就有粘与非粘的区别，而不是外界导入新的基因，所以不算转基因的。官方说法是目前国内没有推广转基因玉米，当然市场上也没有转基因玉米。
糯玉米起源于中国。玉米被引入中国后，在西南地区种植的硬质玉米发生突变，经人工选择而逐渐出现了糯质类型。所以说，粘玉米不是转基因产品。
自转基因玉米问世以来，虽然它的某些改良性状可以符合人们的要求，但是它的安全性仍然饱受争议。科学家及各国政府也对转基因玉米持有不同态度。
法国科学家小白鼠实验：
法国科学家经过对小白鼠长达两年的实验，发现这批被转基因玉米喂养的老鼠普遍患上肿瘤，并有多器官衰竭的症状。法国卡昂大学教授塞拉利尼领导的这个团队表示，这批200个实验鼠的食物主要是孟山都公司新推出的“NK603”转基因玉米。研究者称，做实验的这批小白鼠普遍患上乳腺癌，并出现肝脏衰竭现象。50%的雄鼠和70%的雌鼠提前死亡。
该研究强调，这是首次在长达两年以上只吃转基因谷物的实验鼠身上得出的成果，通常在白鼠身上进行的实验往往只持续90天。研究结果公布后，孟山都公司法国总部称：“我们还需要请专家对研究结果进行评估，现在做出评论为时过早。此前所做的超过300次实验都证明是安全的。”
关于国内转基因玉米的新闻，最火的就是12批54.5万吨美国输华玉米中，检出含有未经我国农业部批准的MIR162转基因成分。各口岸检验检疫机构已依法对这12批54.5万吨进口美国输华玉米作退货处理。
转基因玉米在国内饱受争议：
首先是毒性问题。一些研究学者认为，对于基因的人工提炼和添加，可能在达到某些人们想达到的效果的同时，也增加和积聚了食物中原有的微量毒素。
其次是过敏反应问题。对于一种食物过敏的人有时还会对一种以前他们不过敏的食物产生过敏，比如：科学家将玉米的某一段基因加入到核桃、小麦和贝类动物的基因中，蛋白质也随基因加了进去，那么，以前吃玉米过敏的人就可能对这些核桃、小麦和贝类食品过敏。
第三是营养问题。科学家们认为外来基因会以一种人们还不甚了解的方式破坏食物中的营养成分。
第四是对抗生素的抵抗作用。当科学家把一个外来基因加入到植物或细菌中去，这个基因会与别的基因连接在一起。人们在服用了这种改良食物后，食物会在人体内将抗药性基因传给致病的细菌，使细菌产生抗药性。
第五是对环境的威胁。在许多基因改良品种中包含有从杆菌中提取出来的细菌基因，这种基因会产生一种对昆虫和害虫有毒的蛋白质。在一次实验室研究中，一种蝴蝶的幼虫在吃了含杆菌基因的马利筋属植物的花粉之后，产生了死亡或不正常发育的现象，这引起了生态学家们的另一种担心，那些不在改良范围之内的其它物种有可能成为改良物种的受害者。
最后，生物学家们担心为了培养一些更具优良特性，比如说具有更强的抗病虫害能力和抗旱能力等，而对农作物进行的改良，其特性很可能会通过花粉等媒介传播给野生物种。
虽然说，转基因是未来满足全球人口不断增长的饮食必然需要，但是转基因带来的健康方面的问题也饱受争议，至于转基因玉米的特点方面的问题，很难用肉眼判断的，这就要求商家应该本着诚实经营的原则，对于食物的品种通过商标如实的反映出来，让消费者拥有真正的知情权，也让消费者真正的体验转基因的是是非非。
转基因玉米的专家观点：
虽然中国已经给进口玉米掀开了一个口子，但是该不该进口，仍然存在激烈争议，而且两派的观点都是以“粮食安全”为主要理由。反对进口的一派以大豆为前车之鉴，强调避免玉米重蹈大豆覆辙关乎中国粮食安全和稳定;支持进口的一派则认为，利用国际上便宜的粮食平抑国内粮价波动，同样是维持粮食安全的重要举措。
方立锋说：“对转基因技术的安全性研究时，这些生物公司有着自己的意见。我们鼓励中国政府充分考虑到转基因技术的长期安全性以及该技术涉及的知识产权隐患，将更多的资源投入到长期安全性的更彻底研究中，而不是仓促推动转基因技术的商业化。”
中国农业大学食品学院副院长黄昆表示，转基因产品的安全与否不能一概而论，评价转基因产品的原则是个案分析。因为不同的转基因食品有不同的特殊技术，需要具体问题具体分析。另外，黄昆仑表示，转基因技术也无法用利大还是弊大来衡量，因为这项技术是一个中性技术，但是随着转基因技术的逐渐发展以及评估技术的成熟，转基因技术未来将会在农业和医学上大放异彩，安全性也会越来越高。
2013年9月7日上午，在工程院院士戴景瑞等专家带领下，二十多名主动报名的网友来到中国农大玉米试验基地采摘转基因玉米，并煮熟品尝。活动发起人方舟子称，品尝转基因玉米虽无研究价值，但有科普价值，应创造条件让国人可以天天吃转基因食品。方舟子表示，网上流传的“吃转基因玉米后老鼠长肿瘤”等，都是针对转基因食品的谣言。