艾灸治痛经是通过艾叶的特有气味与温热的刺激，来调整体内机能，达到缓解子宫肌肉反射性痉挛、解痉活血通络止痛的目的。
这就是中医所说的“通则不痛，痛则不通”。
主穴：
关元在脐下3寸，腹中线上，仰卧取穴。取穴时，可采用仰卧的姿势，关元穴位于下腹部，前正中线上，从肚脐到耻骨上方画一线，将此线五等分，从肚脐往下五分之三处，即是此穴。
气海在下腹部正中线上，当脐下1.5寸处。
三阴交在小腿内侧，当足内踝尖上3寸，胫骨内侧缘后方；正坐屈膝成直角取穴。
配穴：次髎、中髎、天枢、归来、曲骨。
治疗时，病人首先选取仰卧位，点燃艾条，在距离穴位约2公分的空中熏烤以局部皮肤有灼热感为度。然后改俯卧位，同法灸治背面的次髎或中髎穴。每天进行一次。
穴位的选取，一般主穴每天使用。
但配穴可每天轮换选取2～3个。
选择治疗时间一般在月经来潮前数日开始，到月经干净后数日。